【植物代謝組學】——方法與應用

編輯推薦

1.是國家十一五重點圖書《植物代謝組學》（一版）的修訂再版，原版圖書版權輸出至Springer，並作為該公司亞太區重點圖書獲得高度評價。

2.本書每章作者都是本領域國內領銜代表專家，著述認真負責，科學可靠，本書是相關代謝組學研究領域的經典參攷圖書，受到業內廣泛認可。

3.本書二版在原版基礎上對代謝組學新技術、新方法、新成果、新趨勢做了詳細介紹，新新增了“脂質代謝組學”一章，新增了高端分析儀器應用介紹比如離子淌度質譜、成像質譜、全二維色譜、多平臺組學科技、多組學科技的開發應用，精准代謝組學研究比如靶向代謝組學、 廣泛靶向代謝組學技術分析策略，相關分析軟體和算灋的智能化分析，將組學研究報告進行標準化，並提供了附錄《基於質譜的代謝組學：注釋、定量和*佳報告實踐指南》資料翔實，科研案例豐富，步驟講解細緻，參攷性强。

內容簡介

本書介紹了代謝組學的科技及應用概況、代謝組學的氣相色譜-質譜聯用科技、液相色譜-質譜聯用科技、核磁共振科技、代謝組學數據預處理方法、基於代謝組學數據的多變數分析、基於色譜-質譜聯用科技的代謝物定性，並介紹了植物脂質組、植物代謝網路分析，還講解了這些科技的具體應用案例， 比如LC-MS在植物代謝組學中的應用、NMR在植物發育和其應答生物/非生物脅迫中的應用、代謝組學方法在中藥研究中的應用。 本書最後介紹了代謝組學領域最新的研究趨勢，比如代謝組數據的深度挖掘及應用，並將“基於質譜的代謝組學：注釋、定量和最佳報告實踐指南”作為附錄介紹給大家，參攷性非常强。

本書適合高等院校、研究院所生物、化學、醫藥、農業相關專業的大學生、研究生、科研工作者及專業科技人員參攷學習。

作者簡介

漆小泉，中科院植物研究所，博導、研究員，現任中國科學院植物研究所植物次生代謝及抗病信號轉導創新研究組組長。 迄今出版論著1部，發表SCI收錄刊物論文30餘篇。

陳曉亞，植物生理學家，中國科學院院士、开发中国家科學院院士，中國科學院上海生命科學研究院植物生理生態研究所研究員、博士生導師，中國科學院上海辰山植物科學研究中心主任，兼任上海辰山植物園園長。 主要從事植物次生代謝調控及表皮細胞發育，早期曾從事植物分類學研究。

王玉蘭，現任南洋理工大學教授，曾任中國科學院武漢物理與數學研究所研究員、博士生導師，磁共振與原子與分子物理國家重點實驗室主任，生物光譜和代謝學學科帶頭人。

目錄

第1章概述001

1.1代謝物分析科技的發展趨勢003

1.2代謝組學資料分析現狀及其面臨的挑戰008

1.3植物代謝組學的應用013

參考文獻019

第2章代謝組學分析科技：氣相色譜-質譜聯用科技026

2.1 GC-MS聯用的原理和關鍵技術027

2.2樣品製備和分析科技035

2.3新技術、發展趨勢039

2.4常見問題，注意事項041

2.5展望044

參考文獻045

第3章代謝組學分析科技：液相色譜-質譜聯用科技047

3.1 LC-MS基本原理048

3.2數據解讀052

3.3新技術與發展趨勢053

3.4常見問題和注意事項057

3.5展望061

參考文獻061

第4章代謝組學分析科技：核磁共振科技064

4.1核磁共振發展概況065

4.2核磁共振基本原理065

4.3核磁共振波譜儀067

4.4化學位移068

4.5自旋耦合075

4.6常見基團的化學位移範圍076

4.7代謝組學研究中常用的二維譜082

4.8核磁共振譜圖解析084

4.9常見問題及解決方案095

4.10植物代謝組學研究中樣品的選取方法097

4.11新技術及發展趨勢098

參考文獻100

第5章代謝組學數據預處理分析方法102

5.1 NMR數据集的預處理103

5.2 MS數據預處理106

參考文獻113

第6章基於代謝組學數據的多變數分析115

6.1引言116

6.2基於單維統計模式識別116

6.3多元統計模式識別118

6.4資料模型的識別和驗證129

6.5模式識別的軟體工具130

6.6代謝組和其他組學數據的聯合分析132

6.7小結140

參考文獻140

第7章基於色譜/質譜聯用科技的代謝物定性144

7.1引言145

7.2常見有機物質譜裂解規律148

7.3 GC-MS代謝產物定性方法150

7.4 LC-MS代謝產物定性方法157

參考文獻164

第8章植物脂質組167

8.1植物脂質簡介168

8.2植物脂質的功能176

8.3植物脂質碎裂規律179

8.4植物脂質組樣品製備181

8.5脂質組學分析工具183

8.6多組學聯合分析189

8.7展望190

參考文獻192

第9章植物代謝網路197

9.1引言198

9.2植物代謝網路的特徵199

9.3植物代謝網路的分子生物學研究206

9.4存在問題與展望212

參考文獻213

第10章LC-MS在植物代謝組學中的應用220

10.1分析樣品製備222

10.2 LC-MS在基因功能研究中的應用223

10.3代謝組與基因組重測序數據關聯確定候選基因228

10.4應用於轉基因植物“實質等同性”檢測229

參考文獻233

第11章NMR在植物發育和其應答生物/非生物脅迫中的應用235

11.1引言236

11.2 NMR在綠豆種子發育中的應用236

11.3 NMR在水稻抗蟲中的應用243

11.4 NMR在烟草應答鹽脅迫中的應用251

11.5機遇與挑戰258

參考文獻258

第12章代謝組學方法在中藥研究中的應用261

12.1引言262

12.2黃芪藥材的多基源鑒別262

12.3丹參酮類化合物生物合成途徑解析274

12.4天麻硫熏綜合評估分析282

參考文獻289

第13章代謝組數據的深度挖掘及應用292

13.1植物代謝組學檢測平臺293

13.2植物代謝組學資料分析方法298

13.3植物代謝物注釋306

13.4植物代謝組學的應用308

13.5展望310

參考文獻311

附錄320

附錄1基於質譜的代謝組學：注釋、定量和最佳報告實踐指南321

附錄2中英文縮略語錶334